Мутационный тестирование становится все более важным, на протяжении многих лет и в настоящее время рекомендуется для метастатических пациентов GIST высокого риска.
КIТ экзонные мутации в GIST(ГИСО)
Информация, содержащаяся в генах разделена на различные секции, называемые экзоны и интроны. Экзоны содержат информацию кодирования а интроны нет. Мутации в различных экзонах гена вызывают изменения формы в разных частях КИТ рецептора. Мутации гена c-kit говорит о диагнозе GIST а следующие экзоны:
Экзона 11 - Это наиболее часто мутирующая экзона в GIST. Она мутирует примерно в 60% случаев. Мутации в экзоне 11 обычно отвечают на лечение иматинибом лучше, чем мутации в других экзонов.
Экзона 9 - является второй наиболее распространенной мутацией, встречаются в 10% случаев. Опухоли размещены в тонкой и толстой кишке, примерно у 98% пациентов, которые имеют экзона 9 мутацию; Однако, они не составляют большинство случаев, которые встречаются в тонкой или толстой кишке. На самом деле, около 2/3 случаев, которые встречаются в тонкой и толстой кишке являются КIТ экзон 11 мутации. GIST с экзона 9 мутаций имеют более низкий уровень ответа на иматиниб терапию, по сравнению с экзоной 11 мутаций, в этом случае требуют более высокой дозы. Они также, хорошо отвечают на терапию Сутента.
Экзон 13 и экзон 17 редкие мутации в GIST.
PDGFRA мутации в GIST
Некоторые опухолевые клетки GIST не содержат с-КIТ мутации. Примерно 7-8% всех случаев GIST, тесно связаны с геном PDGFRA,который мутирует. Около 1/3 PDGFRA мутаций может еще ответить на Гливек и / или Сутента, но до 2/3 PDGFRA мутаций не реагируют на эти препараты. Эти мутации происходят в одном конкретном месте в экзоне 18 гена и называются D842V мутации (мутаций PDGFRA, экзон 18, D842V). Хотя не были испытаны на пациентах препараты против этой мутации, в клинике дазатиниб (утвержденный для ХМЛ) и ингибиторов Hsp90 (в испытаниях), подавляют D842V мутацию в пробирке при экспериментах.
Дикий тип GIST
GIST опухоль, которая не имеет мутацию в KIT или PDGFRA называют "дикий тип" с-КIТ, уже находят, что некоторые из этих опухолей имеют мутации в других генах, таких как BRAF или SDH мутаций (2007-2008). GIST с опухолями дикого типа а также других типов не реагируют на лечение, но, поскольку некоторые сигналы могут идти через KIT рецептор, лечение иманитибом является полезным в некоторых случаях. Иматиниб не очень мощный ингибитор дикого типа KIT. Более мощные ингибиторы дикого типа KIT, это Сутента и Tasigna (нилотиниб), могут быть эффективными для дикого типа GIST. Дикий тип GIST называемый IGF1R сверхэкспрессия белка,около 2/3 изученных случаев. В результате исследования с IGF1R планируется провести исследовние с GIST.
SDH и BRAF мутации
ПРИМЕЧАНИЕ: Тестирование на SDH и BRAF мутации еще не являются частью стандартного мутационного тестирования. BRAF тестирование доступно через университет Орегона здоровья и науки (OHSU) и Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSKCC). Тестирование SDH можно получить в Национальных Институтов Здоровья (NIH).
В 2007 году д-р П. Айдан Карни, доктор Константин Stratakis и другие члены Карни-Stratakis Dyad консорциума сообщили, что некоторые пациенты GIST имеют семейную тип GIST вызывается мутациями в одном из четырех генов, участвующих в производстве сукцинатдегидрогеназу (SDH) белка. Этот тип наследственной мутации могут привести к состоянию, которое называется Carney-Stratakis синдром. Для получения дополнительной информации см. Carney-Stratakis синдром . В дополнение к SDH белка инактивированым путем мутаций, д-р Katherine Джэнвей и его коллеги показали, что GIST опухолей педиатрический типа также теряют экспрессию белка SDHB некоторым другим механизмом (не мутантного SDH).
Исследователи Мемориал Слоан-Кеттеринг онкологический центр (MSKCC) в Нью-Йорке нашли редкую мутацию в некоторых GIST опухолей. В исследовании участвовали 61 пациент с диким типом GIST, они обнаружили, что три из них (5%) имели мутации в гене под названием BRAF. Это же мутация, "V600E" мутация в экзоне 15 гена BRAF, часто встречается в меланомах. Они также обнаружили, ту же мутацию в одном из 28 GIST пациентов, которые были устойчивы к Гливек. Для получения дополнительной информации см.MSK команда находит редкий новый мутацию .
КИТ & PDGFRA мутации гена скрининг
Фон и интерпретация данных
Примерно 80-85% желудочно-кишечных стромальных опухолей (GIST) имеют онкогенные мутации в гене, кодирующем КИТ тирозинкиназы. Еще 5-7% GIST имеют мутацию в гене, кодирующем связанной киназы PDGFRA (тромбоцитарный рост альфа-рецептор фактора). КИТ и PDGFRA мутации являются взаимоисключающими в GIST. В обоих генах, мутации, наблюдаемые в результате экспрессии мутантной формы киназы что конститутивно "включается" и помогает стимулировать рост опухоли. Примерно 7-12% от GIST не имеют никакой обнаруженной KIT или генную мутацию PDGFRA. Что поддерживает рост этого подмножества GIST остается неясным.
На основании промежуточного анализа ЦНТИ-B2222 фаза II суда мезилата иматиниба в лечении не-исправном опухоли злокачественные Г.И. стромы, существует взаимосвязь между статусом мутации киназы о GIST и вероятность ответа препарата, как показано в в таблице ниже.
| Последующее наблюдение для общего СУТИ подгрупп |
Частота в Фаза II Судебная | Гливек частичный ответ |
Гливек Стабильный Болезнь |
Гливек прогрессирующее заболевание |
| КИТ Эксон 11 мутация (п = 82) | 67% | 86,5% | 8,5% | 4,9% |
| КИТ Эксон 9 вставки (п = 21) | 18% | 19% | ||
| Нет КИТ или мутация PDGFRA (п = 8) | 7% | 0% | 37,5% | 62.5% |
| Последующее наблюдение Для логи с редкими мутациями | ||||
| PDGFRA D842V (п = 2) | 1,6% | - | - | 2 из 2 очков |
| PDGFRA друга (п = 3) | 2,3% | 2 из 3 очков | - | 1 из 3 очков |
| КИТ Эксон 13 (п = 2) | 1,6% | 2 из 2 очков | - | - |
| КИТ Эксон 17 (п = 2) | 1,6% | 1 из 2 очков | - | 1 из 2 очков |
Кроме того, что более высокий уровень ответа на терапию, пациенты с GIST скрывается в экзоне 11 мутации, более долговечным ответом и лучшую общую выживаемость, чем те, которые имеют экзона 9 мутаций или тех, у кого не определена мутация, выявленна в любом гена киназы.
Методика
Испытания проводятся в два этапа. KIT экзоны 9 и 11 показаны на экране сначала, как примерно 80% GIST будет иметь мутацию в одном из этих двух экзонов. КИТ экзонов 13 и 17, и PDGFRA экзоны 12 и 18, проверяются на втором этапе. Если никаких мутаций не обнаружено в этих экзонах, опухоль, как предполагают, "дикого типа", хотя остается небольшим (менее 1%) возможность того, что мутации было пропущено в другом месте в любом гене.
ДНК экстрагировали и очищали из парафин опухолевой ткани. Указанные экзоны комплекта и PDGFRA генов усиливаются с помощью ПЦР, и продукты проверяются на наличие мутаций в денатурирующих высокоэффективной жидкостной хроматографии (WAVE системы, Transgenomic, Inc.) На основе анализа более 400 образцов GIST, чувствительность и специфичность этого комбинированного HPLC плюс секвенирования подхода> 98%.
Как сделать заказ испытание
https://liferaftgroup.org/mutations-and-mutation-testing/
Д-р Кристофер Corless
Источник: http://alianzagist.org/en/about-gist/basics-of-gist/diagnosis-and-monitoring/mutational-testing/